5.5. Классификация аминокислот на основе их R-групп

Рассмотрим теперь структуру 20 аминокислот, встречающихся в белках. Дело облегчается тем, что все аминокислоты можно сгруппировать на основе признаков, свойственных их R-группам. в частности их полярности (табл 5-3), т.е. способности R-групп к взаимодействию с водой при биологических значениях pH (вблизи pH 7,0).

Таблица 5-3. Классификация аминокислот в соответствии с полярностью их R-rpynn (при pH=7)

По степени полярности все -гругпты аминокислот можно расположить в виде непрерывного ряда, начиная от полностью неполярных, или гидрофобных (т.е. водоотталкивающих), R-rpynn и кончая сильно полярными, или гидрофильными («любящими» воду), R-группами.

Строение 20 стандартных аминокислот показано на рис. 5-6. Имеется четыре основных класса аминокислот, содержащих R-группы следующих типов: 1) неполярные, или гидрофобные, 2) полярные, но незаряженные, 3) отрицательно заряженные и 4) положительно заряженные. Внутри каждого класса имеется определенная градация по полярности, размерам и форме R-rpynn.