Рис. 25.17. Последовательность ДНК, соответствующая 3-концу trp-мРНК E.coli. Последовательности оснований, показанные желтым цветом, обладают симметрией второго порядка относительно оси, обозначенной зеленым цветом.
результат свидетельствует о том, что матрица содержит но крайней мере три участка терминации, чувствительных к белку (они дают и один участок терминации, не требующий белка (дает 23S-PHK). Следовательно, специфическая терминация может происходить и в отсутствие белка Однако белок выявляет дополнительные сигналы терминации, которые сама по себе РНК-полимераза узнавать не может.
Каким образом белок вызывает терминацию синтеза РНК по достижении определенных сигналов терминации? Одна из возможностей состоит в том, что этот белок-тетрамер с массой садится на РНК и движется по направлению к молекуле РНК-полимеразы, останавливая ее на участке терминации. Согласно этой модели, белок вытесняет РНК-полимеразу с 3-конца РНК, что приводит к высвобождению РНК-транскрипта. Интересно отметить, что при терминировании транскрипции белок гидролизует АТР.
Как можно было предвидеть, терминирование транскрипции некоторых генов контролируется. В ходе дальнейшего изложения мы увидим, что бактериофаг X синтезирует белки-антитерминаторы, обеспечивающие возможность транскрипции и экспрессии некоторых генов (разд. 28.11), У Е. coli действует система регуляции с использованием специализированных терминирующих сигналов, называемых аттенюаторами, для обеспечения пищевых потребностей клетки (разд. 28.9).
Рис. 25.18. Последовательность оснований 3-конца мРНК, транскрибированной с триптофанового оперона E.coli. Возможно образование стабильной структуры шпильки.
Рис. 25.19. Влияние фактора на размер транскрибируемых РНК.