2.11. Структурные уровни в архитектуре белков
Принято различать четыре структурных уровня в архитектуре белковой молекулы. Первичная структура - это просто последовательность аминокислот в белке и локализация дисульфидных мостиков, если таковые имеются. Таким образом, первичная структура представляет собой полное описание ковалентных связей в белке. Вторичная структура образуется в результате стерического взаимодействия аминокислотных остатков, расположенных вблизи друг друга в линейной последовательности. Некоторые из этих стерических взаимодействий носят регулярный характер, обусловливая тем самым периодичность структуры. Примерами вторичной структуры могут служить -спираль, складчатый -слой и коллагеновая спираль. Третичная структура обусловлена стерическим взаимодействием аминокислотных остатков, далеко отстоящих друг от друга в линейной последовательности. Следует отметить, что различие между вторичной и третичной структурами довольно условно. Белки, содержащие несколько полипептидных цепей, обладают еще одним уровнем структурной организации, а именно четвертичной структурой. Под четвертичной структурой подразумевают способ
Рис. 2.41. Антипараллельный -складчатый слой, Прилежащие тяжи полипептидной цепи идут в противоположных направлениях. Структура стабилизирована водородными связями между и СО-группами прилежащих тяжей. Боковые цепи (показаны зеленым) лежат выше и ниже плоскости слоя.
Рис. 2.42. Структура -изгиба, СО-группа остатка 1 изображенного здесь тетрапептида присоединяется водородными связями к -группе остатка 4; в результате образуется такой же изгиб, как в шпильке.
укладки цепей относительно друг друга. Каждая полипептидная цепь в таком белке носит название субъединицы. Часто используют также термин домен, которым обозначают компактную глобулярную единицу белковой структуры. Многие белки состоят из нескольких доменов с массой от 10 до В белках большой молекулярной массы отдельные домены соединяются между собой относительно гибкими участками полипептидной цепи.